药物诱导肝损伤(DILI)是药物研发失败、上市后撤市的首要原因之一,传统评估模型存在显著局限:2D肝细胞单层培养缺乏生理相关性,药物代谢功能快速衰退;动物模型与人类代谢差异大,预测准确率不足60%,且难以满足高通量筛选需求。为破解这一痛点,本研究由InSphero与FDA国家毒理学研究中心(NCTR)联合开展,开发了基于384孔板的生理肝微组织高通量筛选系统——核心依赖I.DOT非接触式纳升级移液系统的精准试剂分配能力,实现152种FDA批准小分子药物的高效评估,构建出“高预测性+高通量+低消耗”的临床前肝毒性评估新方案。该系统不仅还原了体内肝脏微环境的细胞互作与代谢功能,更将药物安全性筛选的精准度与效率提升至新高度,为药物研发早期风险管控提供关键支撑[1]。
采用InSphero的3D Insight™人肝微组织(含原代肝细胞与非实质肝细胞,生理比例共培养),适配384孔Akura™球状体微孔板(优化球状体形成与营养交换),测试152种FDA批准的小分子药物(含DILI高风险、低风险及无风险药物,覆盖14个治疗领域,Figure 1)。核心检测指标为药物暴露后肝微组织的ATP含量(反映细胞活力,作为毒性终点),辅助验证肝微组织的长期功能(白蛋白分泌、CYP450酶活性)。

图1. FDA批准的152个药物组合的说明。药物与DILI关注类(DILI关注,左面板)、与肝毒性相关的警告(药物标签,中间面板)、药物标签上的DILI说明(DILI说明,右侧面板)的示意图。
药物试剂精准分配:通过I.DOT完成两大关键步骤:①将152种药物分别稀释为系列浓度(含DMSO溶剂,浓度最高兼容100%),以3~50 nL/孔的精度分配至384孔板,确保每孔药物浓度均一性(CV<5%),避免手动操作的交叉污染与体积偏差;②向每孔分配维持肝微组织功能的培养基补充液,纳升级精准控制营养供给,适配384孔板的微量反应体系(Figure 2实验流程)。I.DOT的DropDetection功能实时监测液滴释放,进一步保障分配可靠性,且PureWell设计使试剂残留<1 μL,大幅降低珍贵药物试剂的消耗。

图2. 在hLiMT中测试的药物的血药浓度和细胞毒性。A)血浆总Cmax值,b)IC50ATP值,以及c)FDA批准的152种药物的IC50ATP值与总血浆Cmax比率(C2C)与其DILI关注级别的关系。使用Dunn的多重比较检验显示了不同类别之间的统计差异以及P值。
实验流程整合:肝微组织在384孔板中预培养至功能稳定(第7天),经I.DOT分配药物后孵育后,采用CellTiter-Glo 3D试剂盒检测ATP含量,计算IC50值;通过5折交叉验证优化数据阈值(IC50/血浆峰浓度Cmax=176),区分毒性与安全药物;同步检测培养14~35天的肝微组织白蛋白分泌量与CYP1A2、CYP3A4酶活性,验证模型生理相关性(Figure 3)。

图3. C2C比率与药品标签信息的关系。A)152种FDA批准的药物的C2C比率与其肝毒性安全警示相对照,以及b)FDA批准的98种药物(“vmo-Dili-concern”和“vMost-Dili-concern”)的C2C比率与其Dili描述的对照。使用邓恩多重比较检验的组之间的统计差异以及它们的P值被表示出来。在C2C=176处画了一条虚线。
该系统对“最受关注DILI”药物的预测灵敏度达72%、特异性89%,对因肝毒性撤市的药物检测率高达80%(Figure 4)。针对神经系统靶向的肝毒性药物,灵敏度与特异性进一步提升至92%和91%,远超2D肝细胞模型(平均灵敏度<50%)与常规动物模型(预测准确率<60%)。5折交叉验证结果显示,模型稳健性良好,无明显批次效应(Figure 5),证明I.DOT保障的药物分配均一性是数据可靠性的核心前提。
图4. C2C评分与DILI关注类、解剖或药理学组的关系。A)“神经系统”解剖学组。B)“心血管系统”解剖学组。C)“消化道与代谢”解剖学组。D)“全身用抗感染药”药理组。使用邓恩多重比较检验的组之间的统计差异以及它们的P值被表示出来。在C2C=176处画了一条虚线。
图5. 实验运行和肝细胞批次的重复性。FDA批准的20种药物在3个不同的10供体肝细胞批次的hLiMT中两次测量C2C比率:批次IPHH_32(开环)、批次IPHH_24(黑色钻石)和批次IPHH_18(灰色三角形)。在批次IPHH_32中进行的初始测量被描绘为全黑圆圈。在C2C=176处画了一条虚线。
384孔板中的肝微组织可维持关键肝脏功能35天以上:白蛋白分泌量持续稳定在生理水平,CYP1A2、CYP3A4等药物代谢酶活性保持率超85%(Figure 3),显著优于2D培养(功能维持不足7天)。这一特性使其不仅适用于急性毒性筛选,还可模拟药物长期暴露的慢性肝损伤,进一步拓展了临床前评估的应用场景。
借助I.DOT的8通道协同分配能力,单块384孔板可在20秒内完成药物分配,单日可处理上千个药物浓度梯度样本,满足早期药物筛选的高通量需求。同时,纳升级试剂分配使单孔药物用量降低至纳升级,相比传统方法减少90%以上试剂消耗,大幅降低研发成本。
本研究的核心突破在于将“生理相关性”与“高通量筛选”高效结合,而I.DOT非接触式纳升级移液系统是实现这一突破的关键技术支撑——其对药物试剂(含DMSO溶剂)的纳升级精准分配,解决了384孔板微量反应体系的均一性难题,避免了交叉污染,同时降低试剂消耗;DropDetection实时质控功能则为高通量数据的可靠性提供了双重保障,完美适配临床前药物筛选的严苛需求。
与此前单细胞测序、蛋白组学相关推文不同,本研究聚焦药物研发转化场景,突出技术的实用价值:相比传统模型,该系统不仅预测准确率提升30%以上,还能兼容152种不同类型药物的筛选,覆盖多数治疗领域;384孔板与I.DOT的自动化适配,可直接整合至现有药物研发流程,缩短筛选周期3~6个月,减少晚期研发失败风险(据估算可节省数千万美元研发成本)。
应用前景方面,该系统为“替代动物实验”提供了有力工具,契合3R原则(替代、减少、优化),未来可进一步拓展至中药、生物药的肝毒性评估,或联合代谢组学、转录组学挖掘DILI分子机制。而I.DOT在药物溶剂兼容性、微量分配效率上的优势,也为其他器官微组织(如肾、心)的高通量毒理学筛选提供了可复用范式,推动临床前安全评估向“精准化、高通量化、生理化”转型。

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1、Fäs L, Chen M, Tong W, Wenz F, Hewitt NJ, Tu M, Sanchez K, Zapiórkowska-Blumer N, Varga H, Kaczmarska K, Colombo MV, Filippi BGH. Physiological liver microtissue 384-well microplate system for preclinical hepatotoxicity assessment of therapeutic small molecule drugs. Toxicol Sci. 2025 Jan 1;203(1):79-87.

