单细胞RNA测序（scRNA-Seq）中使用核分离技术对神经细胞等难以分离的细胞类型极具价值。但是细胞核极其脆弱，一些分离方法过于激进，可能导致核质量低下或发生裂解，并且可能会产生大量碎片，导致测序质量下降。因此，完善的样本制备直接决定了测序结果的质量。
实验证实，使用细胞分选仪进行样本净化有助于去除杂质碎片。此外，鉴于细胞核的脆弱性，温和的分选操作至关重要。WOLF与WOLF G2细胞分选仪均为温和的微流控荧光激活细胞分选仪，可在极低剪切应力下高效去除样本中的杂质。此外，这两款仪器采用无气溶胶的可抛弃式分选芯片，可避免样本间交叉污染，从而降低生物危害风险。
本文将广受认可的"弗兰肯斯坦"核分离方案与WOLF及WOLF G2细胞分选仪结合，展示一种温和的制备细胞核样本的工作流程，可从冷冻脑组织中分离出碎片含量极低的高质量细胞核。
在分选前，样本经7-AAD染色判定约有33%为细胞核，其余物质为不需要的细胞组织。这一结果也通过显微镜下观察到的显著碎片量得到印证（下图A）。基于7AAD荧光信号进行单核细胞核分选后，细胞核比例增至约88%。显微镜观察证实：经轻柔离心处理后未见碎片，核结构完整（下图B）。
在使用DAPI染料区分的样本中也获得了类似结果：分选前样本中41%为细胞核。分选后，核细胞比例富集至91%，显微镜下仅观察到极少量碎片（下图）。
由于机械应力较低，WOLF和WOLF G2细胞分选仪能够轻柔精准地分选细胞核，同时去除不需要的碎片，分选后轻柔离心处理仍能保持高品质细胞核核。这些结果表明该工作流程适用于下游基因组学应用，例如需要高品质浓缩输入样本的10x Genomics检测。综上所述，本实验验证了一种稳健的工作流程，证明了WOLF和WOLF G2可在不损害核细胞质量的前提下优化核细胞纯度。
