在
线
留
言
现代医学提供了一系列治疗急性髓系白血病(AML)等疾病的方案。癌症是由状态各异的细胞组成的异质混合体,要想对单个患者做出最佳的治疗方案,需要从细胞水平上了解疾病状态。 单细胞多组学方法是实现在细胞水平上全面解析疾病,揭示基因型和表型之间相互作用的唯一途径。
在此,我们展示了Tapestri平台通过单细胞多组学剖析,实现了细胞亚群的全面识别。该平台从混合的AML细胞系和AML研究样本中检测到单核苷酸变异(SNVs)、拷贝数变异(CNVs)和单细胞中的细胞表面蛋白表达。
单细胞多组学
当SNV或CNV数据分别与蛋白质数据相结合时,细胞系的分辨率增加;而将SNV、CNV数据和蛋白质数据结合在一起,使得t-SNE图上4个细胞系群体的分辨率最高。该结果说明了通过多组学方法,使用来自相同细胞的更多数据,能获得细胞类型之间超高的分辨率。
背景知识
靶向测序:有选择性地测序基因组的部分区域,而不是全部,都是靶向测序。从单基因panel、小panel、大panel、CES到WES,都属于靶向测序。所希望测序的区域称为靶区域(包括靶基因、靶位点)。靶区域的捕获-富集主要有两种方法:探针杂交和多重扩增。靶向测序主要是为了节省成本、简化分析。
产品优势
CNV+SNV+蛋白多组学分析;
更低成本:靶向基因检测;
更高分辨率:可以更精准地分辨细胞群和细胞亚种群,解决细胞异质性难题;
有效降低PCR偏差:UMI(特异性的分子标签)降低非特异性扩增;
商业化仪器:通量高,周期快,操作简便;
商品化与客户定制化方案;
兼容性高:新鲜和冷冻组织样本;